黑龙江中医药大学始建于1954年，是黑龙江省重点建设的高水平大学。学校于2004年获得全国首批教育部本科教学工作水平评估优秀结论，2007年全国首家通过教育部本科中医学专业认证单位，2008年被确定为国家中医临床研究基地建设单位，2010年通过新加坡中医管理委员会中医学历认证。

学校下设11个学院、11个附属医院、1个研究院、24个教学医院和62个实习基地。有3个博士后科研流动站，28个博士学位授权点，36个硕士学位授权点，21个本科专业。

学校从80年代初开始招收外国留学生，目前已培养留学生5000余人，与世界上30多个国家和地区的医学院校或研究机构建立了密切的科技合作与学术交流关系，并在英国建立了全球首家中医孔子学院。